酵母菌作为分子生物学研究的重要工具,基因组注释明确,各种基因操作手段成熟。作为传统的模式生物,为了满足不同科研工作的需求,酵母菌基因组改造技术应运而生
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1. 总RNA提取与质检2. 已知序列的验证3. 合成5'和3' RACE-ready cDNA第一链;通过LD-PCR分别进行5' 和3' RACE4. 基因未知序列验证
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传统的真菌分类鉴定主要是按照真菌的形态、生长以及生理生化等特征对真菌进行分类。然而真菌的种类繁多,个体多态性明显,而且其生长、生理生化特征也会随着环境的变化而不稳定。因此,采用传统的方法对真菌进行正确的分类存在较大的困难。
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鸟枪法战略(Shotgun Strategy)又称随机测序战略,是由美国塞莱拉遗传公司创始人克雷格•文特尔发明,主要针对大片段的全长测序
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TA克隆技术(TA cloning)利用Taq聚合酶具有末端转移酶(TdT)活性,但却不具有3''''-5''''端外切酶校准活性的特点,可在PCR产物的3''''端加上一个非模板依赖碱基“A”。
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MetaEnvironmental Genomics, Ecogenomics, Community Genomics环境基因组、宏基因组、元基因组…
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MiSeq测序系统采用Illumina成熟的TruSeq边合成边测序技术,它是唯一一台在单个仪器上整合了扩增、测序和数据分析的新一代测序仪,每次运行最多能产生超过7 Gb的数据。
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技术特点1. 原理简单,容易掌握,适合短基因片段的SNP筛查。2. 检出率接近100%。3. 可以发现新的SNP位点。
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微生物因为体积小、质量轻、适应性强、繁殖能力强等特点,广泛分布于自然界中。通过DNA测序对微生物进行物种鉴定(菌种鉴定)是比传统生化鉴定更先进的鉴定方法。DNA测序不依赖菌种本身特点,对所有菌种均可使用。比传统生化鉴定更加快速,准确。
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