MiSeq是目前唯一一台在单个仪器上整合了扩增、测序和数据分析的新一代测序仪，每次运行能产生超过1 Gb的数据。MiSeq有着革命性的流程和无可比拟的准确性，这让它成为快速且经济高效的遗传分析的理想平台，适合广泛的应用。

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应用领域：用于生物学、医学、环境学、食品科学和生化药品等的蛋白质分离和鉴定分析

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Illumina公司的Solexa高通量基因组测序仪，测序平均读长已经从一开始的25bp扩展到目前75-100bp，运行一个run(一个run有八个通道)多可以获取50G的碱基数据量，每个样品提供大约2000万个序列标签，超过了过去一台Megabace测序仪近千倍的工作量，并且大大降低了成本。

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